锅炉除尘设备的操作可分为试运行和日常运行。首先，在调试过程中，必须检查单个组件的系统，并且进行性能测试。设备启动后，应密切注意锅炉除尘设备的工作情况，完成相关记录。在锅炉除尘设备运行过程中，应确保滤袋不损坏、滤袋和清灰系统正常运行。还应注意被净化气体湿度和温度的变化。同时，还应避免滤袋过热，否则会造成织物丧失过滤性能。还要注意压力，如果突然增大或减少就可能意味这滤袋堵塞，滤袋有漏洞，阀门不工作，清灰系统不正常或灰斗过满。这时就必需立即处理，各类该分室并解决问题。
当锅炉除尘设备入口气体温度超过限定值时，紧急冷风阀自动打开混入冷风或停止系统引风，以防止因超过滤袋的耐热限度而烧坏的滤袋；在相反情况下，应注意防止温度低于露点温度，而导致水分在除尘器内凝结，防止水蒸气冷凝对滤袋造成堵塞是确保锅炉除尘设备正常运行的条件之一，通常要求进入锅炉除尘设备的烟气温度应高于烟气露点温度20度以上。若除尘系统设有气体流量仪表，应定时机理处理气体流量。若未设气体流量仪表，可根据上述记录的各参数判断流量变化与否；进而判断系统运行是否正常。当除尘器进出口压差与正常值相差很大时，应查找原因，及时排除可能的故障。在使用定时清灰控制器的时候，需要核对清灰周期的设定是否准确，如果发现不对，应马上进行调整校核。在停止设备运行的时候，除尘器和排风机需要再工作一段时间(排除设备内的粉尘和水分)。
为保持锅炉除尘设备长期良好的运行，做好日常维护工作是很重要的。因此，应对压差、脉冲阀、输灰系统、灰斗振动器和阀门的运行情况，做定期检查。
