锅炉脱硫除尘器实际的脱硫效果不仅仅是设计生产决定的，使用者的使用方法是否正确也是一个重要的影响因素，有些企业的排气量非常大，但是脱硫设备的整体处理能力却达不到要求，如此就必然导致脱硫设备在固定时间内无法处理过量的二氧化硫，因此必然很难达到环保要求。当然，使用是否得当只是原因之一。很多锅炉脱硫除尘器刚开始的时候效果非常好，效率也很高，但时间长了就经常出现问题。导致问题出现的原因其实就是使用者的维护和保养出现了问题。所以，很多时候脱硫效果不好，原因可能是多方面的，使用者必须进行全方位思考，才能找到正确的原因。
脱硫除尘器入口粉尘浓度在50mg/m3以下时.脱硫装置除尘效率很低.在22%以下.一台机组甚至出现入口粉尘浓度为22mg/m3.而出口升高为23mg/m3的现象。除尘效率随着入口粉尘浓度增加而增加.当入口粉尘浓度超过200mg/m3时.脱硫除尘效率能够超过60%.高入口粉尘浓度下洗尘效果更为明显。洗尘效率与入口粉尘浓度的关系统计结果如图1所示。有研究及试验证明.随着除尘器烟尘排放值的减小.烟尘粒径的下降.其烟尘中微细颗粒的比例大大增加.这时脱硫系统的除尘效率将大大降低。
脱硫除尘器除尘效率与不同喷淋层层数的关系。相同条件下.脱硫效率随着喷淋层层数的增加而增加，喷淋层层数对除尘效率影响并不大.设置3层与4层喷淋层脱硫装置除尘效率基本一致.而设置5层喷淋层的2台机组除尘效率甚至更低。对于串联吸收塔(4+3)配置.在其入口粉尘浓度为60mg/m3时.其除尘效率达到55%.高出此入口粉尘浓度区间内除尘效率46%的平均值.串联吸收塔配置可以显著提高除尘效率。
锅炉脱硫除尘器有的在系统设计时将处于系统诸多尘点汇集在同一除尘器系统中脱硫除尘，以节省投资。如果诸多尘点粉尘的比电阻、湿度、及温度相近时可以在设计选型时将其汇集在同一除尘器系统中除尘。但错误的把过多尘点汇集在一台除尘器中，如系统中有一尘点工况变化时，则对影响脱硫除尘器的影响就相当的大。燃用煤种的硫份高于设计煤种；实际烟气量大于设计烟气量；脱硫塔本身设计问题, 液气比选低了;循环泵流量小了;氧化风机的风量小了;操作问题：脱硫塔内的粉尘多了;浆液的氯离子浓度高了;浆液的密度高了。
